O Governo no Estado Federal do Pará é representado por um Chanceler, nomeado pelo Grão-Mestre e que, conjuntamente com os outros 26 Chanceleres do Brasil, constitui a Chancelaria Brasileira. Todos os Chanceleres agem como Embaixadores extraordinários e plenipotenciários (ou Ministros) e excedem em qualidade e dignidade, nos seus respectivos estados, todos os outros membros da Ordem. Compete-lhes informar e assessorar o Grão-Mestre sobre todas as matérias do Governo e representar a Ordem em todas as instâncias e cerimónias oficiais.
O Chanceler do Estado Federal do Pará preside ao Conselho do Estado Federal do Pará, composto pelos Conselheiros da Arquidiocese de Belém do Pará, Dioceses de Santarém, Ponta de Pedras, Marabá, Bragança do Pará, Abaetetuba e das Prelazias de Xingu, Óbidos, Marajó, Itaituba e Cametá. Cada Conselheiro é assessorado localmente por dois Tenentes.